PPGBIO - Dissertações

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Navegando PPGBIO - Dissertações por Autor "Boita, Yasmin Aparecida"

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    Identificação de novos ligantes do receptor 5-HT1B por triagem virtual baseada em modelo farmacofórico 3D: em busca de um tratamento para dependência à cocaína
    (2021) Boita, Yasmin Aparecida; Caceres, Rafael Andrade
    O consumo de cocaína tem aumentado no Brasil e no mundo. A ausência de um tratamento efetivo e evidências de estudos pré-clínicos e clínicos encorajam a investigação de possíveis ligantes do receptor 5-HT1B como alvo molecular para um futuro tratamento para dependência à cocaína. Portanto, a partir de três modelos farmacofóricos 3D baseados nas interações do alvo molecular e a ergotamina, um conhecido agonista desse receptor, utilizando a plataforma Pharmit, obteve-se, em diferentes bibliotecas comercialmente disponíveis um total de 88739 candidatas. Um filtro que seleciona apenas ligantes com características favoráveis a atingirem o SNC foi utilizado por meio da plataforma FAFdrugs, reduzindo para 590 candidatas a serem submetidas às simulações de docking. Esta avaliação, que foi realizada tanto pelo software Autodock 4.2 quanto pelo Vina, prediz a energia livre de ligação de cada ligante das bibliotecas analisadas e o receptor 5-HT1B de acordo com um protocolo estabelecido neste estudo. Com o propósito de avaliar a preferência de interação das candidatas que ocuparam as primeiras posições no ranking das metodologias propostas, realizou-se a simulação de docking destas com outros receptores serotoninérgicos. Além disso, foi avaliada a energia de ligação de dois antagonistas do receptor 5-HT1B com esse alvo, projetando simulações de competição pela interação. Foram analisadas, utilizando o PKCsm as propriedades ADMETox das candidatas com as mais baixas energias de ligação com o receptor 5-HT1B. Com estas análises foi possível verificar que ambas as metodologias de docking utilizadas apresentaram resultados equivalentes e que foi possível eleger cinco candidatas a ligantes que apresentam energia de ligação competitivas a da ergotamina, enquanto que os ligantes antagonistas apresentaram energia de ligação significativamente mais alta, indicando a preferência de interação das candidatas estudadas em face dos antagonistas. Também se observou que há maior possibilidade de interação das candidatas eleitas ao receptor 5-HT1B do que aos demais receptores serotoninérgicos testados.