A trajetória do SARS-CoV-2: retrospectiva epidemiológica no Brasil e análise genômica no Rio Grande do Sul
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Data
2022-06-30
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Editor Literário
Resumo
A pandemia de COVID-19, causada pelo SARS-CoV-2, se espalhou
rapidamente pelo mundo, após sua descoberta no final de 2019. Desde então,
esforços internacionais de pesquisa multidisciplinar têm contribuído com o
combate do avanço do vírus. Diante disso, essa dissertação apresenta dois
estudos que têm como objetivo a análise de dados genômicos do Rio Grande do
Sul (RS) a fim de identificar novas linhagens e mutações importantes e de dados
epidemiológicos para pormenorizar o histórico da pandemia no país. No primeiro,
sequenciamos 56 amostras de 13 municípios do Rio Grande do Sul coletadas
durante a segunda onda pandêmica em março de 2021. O trabalho confirmou a
predominância da variante Gamma no estado, sua difusão a partir de múltiplas
introduções virais e o aparecimento da sublinhagem P1.2. No segundo,
analisamos as sequências brasileiras disponíveis na plataforma GISAID - até 7
de dezembro de 2021, 76.413 genomas e seus metadados - juntamente com as
informações demográficas e epidemiológicas extraídas da base de dados do
IBGE do projeto Brasil.IO. Assim, identificamos as proporções de casos e mortes
em cada região brasileira, a ascensão e declínio das principais linhagens e
variantes e sua incidência sobre a população. Até o momento, a variante Gamma
se trata da mais letal versão do SARS-CoV-2 na história da pandemia no país,
visto que em todas as regiões foi a aparente causa do recorde no número de
casos e mortes por COVID-19. Utilizando genomas completos, metadados e
dados epidemiológicos e demográficos, contribuimos para o entendimento da
evolução e do comportamento do SARS-CoV-2. Promissoramente, este trabalho
tem o potencial de guiar o desenvolvimento de intervenções não
medicamentosas e possíveis soluções para prevenção da doença e proteção da
população.
Descrição
Dissertação (Mestrado)-Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre.
Palavras-chave
SARS-CoV-2, COVID-19, Variantes, Linhagens, Genômica, Epidemiologia, Sequenciamento, Biologia molecular, [en] Variants, [en] Lineages, [en] Genomics, [en] Epidemiology, [en] Sequencing, [en] Molecular Biology