A trajetória do SARS-CoV-2: retrospectiva epidemiológica no Brasil e análise genômica no Rio Grande do Sul

Abstract

A pandemia de COVID-19, causada pelo SARS-CoV-2, se espalhou rapidamente pelo mundo, após sua descoberta no final de 2019. Desde então, esforços internacionais de pesquisa multidisciplinar têm contribuído com o combate do avanço do vírus. Diante disso, essa dissertação apresenta dois estudos que têm como objetivo a análise de dados genômicos do Rio Grande do Sul (RS) a fim de identificar novas linhagens e mutações importantes e de dados epidemiológicos para pormenorizar o histórico da pandemia no país. No primeiro, sequenciamos 56 amostras de 13 municípios do Rio Grande do Sul coletadas durante a segunda onda pandêmica em março de 2021. O trabalho confirmou a predominância da variante Gamma no estado, sua difusão a partir de múltiplas introduções virais e o aparecimento da sublinhagem P1.2. No segundo, analisamos as sequências brasileiras disponíveis na plataforma GISAID - até 7 de dezembro de 2021, 76.413 genomas e seus metadados - juntamente com as informações demográficas e epidemiológicas extraídas da base de dados do IBGE do projeto Brasil.IO. Assim, identificamos as proporções de casos e mortes em cada região brasileira, a ascensão e declínio das principais linhagens e variantes e sua incidência sobre a população. Até o momento, a variante Gamma se trata da mais letal versão do SARS-CoV-2 na história da pandemia no país, visto que em todas as regiões foi a aparente causa do recorde no número de casos e mortes por COVID-19. Utilizando genomas completos, metadados e dados epidemiológicos e demográficos, contribuimos para o entendimento da evolução e do comportamento do SARS-CoV-2. Promissoramente, este trabalho tem o potencial de guiar o desenvolvimento de intervenções não medicamentosas e possíveis soluções para prevenção da doença e proteção da população.