Avaliação do perfil genético e de resistência de isolados clínicos de Streptococcus pyogenes de pacientes da cidade de Porto Alegre
| dc.contributor.advisor | d'Azevedo, Pedro Alves | |
| dc.contributor.author | Sambrano, Gustavo Enck | |
| dc.date.accessioned | 2019-06-18T18:00:53Z | |
| dc.date.accessioned | 2023-10-09T16:32:36Z | |
| dc.date.available | 2019-06-18T18:00:53Z | |
| dc.date.available | 2023-10-09T16:32:36Z | |
| dc.date.date-insert | 2019-06-18 | |
| dc.date.issued | 2018 | |
| dc.description | Tese (Doutorado)-Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre. | pt_BR |
| dc.description.abstract | Introdução: Streptococcus pyogenes, frequentemente referido como Streptococcus grupo A (GAS), é associado a uma variedade de manifestações clínicas. Microrganismos desta espécie são bastante conhecidos por sua virulência. No âmbito de resistência antimicrobiana, os isolados de Streptococcus pyogenes são bastante conhecidos por apresentarem uma alta sensibilidade aos antimicrobianos utilizados na prática clínica, embora se tenha relatos de resistência. Objetivo: Este estudo teve como objetivo avaliar o perfil de genético e de resistência aos antimicrobianos de isolados clínicos de Streptococcus pyogenes. Metodologia: Para a análise do perfil de susceptibilidade 76 isolados de três diferentes hospitais foram coletados e o teste de disco difusão foi realizado para os seguintes antimicrobianos, penicilina, eritromicina, clindamicina e tetraciclina. Destes, 25 isolados foram selecionados para os posteriores testes, sequenciamento do gene emm e análise da presença ou ausência de 24 fatores de virulência. Dos 51 restantes, 4 foram selecionados de acordo com o sítio de isolamento para realização da técnica de sequenciamento do genoma completo e análises subsequentes. Resultados: Todos os isolados foram suscetíveis à penicilina, porém resistência aos outros antimicrobianos foram encontradas e definidas como as seguintes: tetraciclina 32,89%, eritromicina 18,42% e clindamicina 5,26%. Procedendo-se a análise do perfil genético dos 25 isolados, o sequenciamento da proteína M, revelou que o tipo mais prevalente foi o M1. A verificação dos genes de virulência demonstrou que os genes speG, slo, C5a-peptidase e spna estiveram presentes em todos os 25 isolados. Todos os isolados apresentaram genes cromossomais bem como genes carreados por profagos. Os 4 genomas sequenciados apresentaram diferenças pontuais (Proteína M, ST, genes de resistência e regiões de profagos). Contudo, a análise do pangenoma revelou que 75% dos genes foram compartilhados por esses 4 isolados. Conclusões: O perfil de resistência dos isolados demonstrou que alternativas à penicilina estão apresentando taxas de resistência, em certas regiões, altas. A análise do perfil molecular revelou isolados com algumas diferenças pontuais, mas que no âmbito geral possuem genomas muito conservados e similares, todos com potencial de causar doenças invasivas, independente do sítio de isolamento ou tipo de proteína M. | pt_BR |
| dc.description.abstract-en | Background: Streptococcus pyogenes, usually refered as Group A Streptococcus (GAS) are responsible for a variety of clinical manifestations. This specie is well known by its virulence potential due to an extensive range of virulence factors present in their genomes. Regarding to antimicrobial susceptibility, this microorganisms are frequently susceptible to penicillin but some resistance rates were reported for its alternatives such as macrolides. Objective: The aim of this study was to evaluate the susceptibility and genetic profile of Streptococcus pyogenes clinical isolates. Methods: A total of 76 clinical isolates of S. pyogenes were collected from 3 different hospitals. The disk diffusion test was done for the following antimicrobial agents: penicillin, erythromycin, clindamycin and tetracycline. Out of the 76, twenty five were randomly chosen to further investigations such as, emm typing and screening for presence of 24 virulence factors. From the 51 left, 4 were chosen for whole genome sequencing (WGS). Results: All isolates were susceptible to penicillin, however resistance was found to the other antimicrobial agents. Tetracycline, erythromycin and clindamycin resistance rates were as follows: 38.89%, 18.42% and 5.26%. The 25 isolates analysis revealed that M1 was the most frequent among all. The virulence screening demonstrated that four genes were present in all isolates, speG, slo, C5a-peptidase and spna. Also, in all isolates there were chromosomally encoded and phage encoded genes. The WGS analysis revealed that even with differences (M protein, ST type, resistance genes and prophage regions) the overall genomes are similar. The pangenome analysis showed that 75% of the genes are shared among the 4 clinical isolates and that variability its present on the phage encoded regions. Conclusion: Although penicillin remains with rare non-susceptibility rates, the antimicrobial agents used as alternative show some resistance, which may be important to consider for the treatment options. The genomic analysis revealed isolates with some differences but that in an entire genome analysis demonstrated a very conserved genome. | pt_BR |
| dc.identifier.uri | https://repositorio.ufcspa.edu.br/handle/123456789/682 | |
| dc.language.iso | pt_BR | pt_BR |
| dc.relation.requires | Adobe Reader | pt_BR |
| dc.rights | Acesso Aberto Imediato | * |
| dc.rights.uri | http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/ | * |
| dc.subject | Streptococcus pyogenes | pt_BR |
| dc.subject | Perfil Genético | pt_BR |
| dc.subject | Resistência Microbiana a Medicamentos | pt_BR |
| dc.subject | [en] Genetic Profile | en |
| dc.subject | [en] Drug Resistance, Microbial | en |
| dc.title | Avaliação do perfil genético e de resistência de isolados clínicos de Streptococcus pyogenes de pacientes da cidade de Porto Alegre | pt_BR |
| dc.type | Tese | pt_BR |