Epidemiologia de infecções bacterêmicas por Staphylococcus aureus resistentes a meticilina (MRSA) de Porto Alegre

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dc.contributor.advisorDias, Cícero Armídio Gomespt_BR
dc.contributor.advisor-coFalci, Diego Rodriguespt_BR
dc.contributor.authorRiche, Cezar Vinícius Würdigpt_BR
dc.contributor.departmentPrograma de Pós-Graduação em Ciências da Saúdept_BR
dc.date.accessioned2024-12-11T14:39:14Z
dc.date.available2024-12-11T14:39:14Z
dc.date.date-insert2024-12-11
dc.date.issued2022-05-27
dc.descriptionTese (Doutorado) - Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre.pt_BR
dc.description.abstractO Staphylococcus aureus resistentes a meticilina (MRSA) é um importante patógeno humano, associado a uma variedade de síndromes clínicas. A ocorrência de bacteremia associada a esses quadros está associada a elevada morbidade e mortalidade. O entendimento da epidemiologia, tendências clínicas e desfechos é importante para o desenvolvimento de medidas preventivas e protocolos de tratamento. Sob essa perspectica, esse trabalho teve como objetivo analisar a epidemiologia e caracterizar MRSA isolados de infecções bacterêmicas de MRSA oriundos de hospitais de Porto Alegre, Brasil. O estudo compreende dados clínicos epidemiológicos, bem como a caracterização bioquímica e molecular de MRSA isolados de hemocultura de pacientes atendidos em hospitais de Porto Alegre no período de 2014 a 2019. Testes de suscetibilidade aos antimicrobianos foram realizados pelos métodos de disco-difusão e fitas de gradiente. A caracterização genotípica, com detecção de genes de resistência e virulência e a tipagem molecular, foi realizada por detecção in silico por meio de dados obtidos por high throughput sequencing, utilizando a tecnologia Illumina. Como resultado foi verificado uma elevada incidência de bacteremia por S. aureus (68,5 casos/100.000 pacientes/ano) e não foi identificada variação estatisticamente significativa durante o período, sendo a proporção de infecções por MRSA de 22% (variação: 19 a 27%). A maioria dos pacientes foram do sexo masculino (64,3%), com mediana de idade de 62 anos, intervalos interquartis (IIQ) de 51 a 74 anos, que apresentavam múltiplas comorbidades. Dentre as comorbidades mais frequentes cabe destacar: hipertensão (45,2%), diabetes mellitus (31,6%) e cardiopatias (21,1%). Dois escores de gravidade foram avaliados, o Índice de Comorbidade de Charlson com mediana de 5 pontos (IIQ: 3 a 6) e o Escore de Bacteremia de Pitt com mediana de 1 ponto (IIQ: 1 a 4). A maior parte das infecções foram relacionadas à assistência à saúde (IRAS) e o principal foco identificado foram dispositivos intravasculares (28,5%). Além disso, foi evidenciada uma mortalidade de 31,2% em 30 dias, sendo identificados dois fatores de risco independentes para mortalidade: o Índice de Comorbidade de Charlson aOR 1,222 (1,061-1,409; p=0,006) e o Escore de Bacteremia de Pitt aOR 1,726 (1,410-2,112; p<0,001). Os dados sugerem que pacientes com mais comorbidades presentes ou apresentações iniciais de bacteremia com maior gravidade tendem a apresentar maior mortalidade. A terapia antimicrobiana empírica com droga com atividade anti-MRSA foi um fator protetor com aOR 0,319 (0,126-0,806; p=0,016). A maioria dos isolados de MRSA apresentou perfil de resistência a mais de um antimicrobiano além dos betalactâmicos, com um total de 35,1% dos isolados multirresistentes. Por meio da caracterização molecular desses isolados, foram detectados cinco diferentes tipos de SCCmec, sendo o SCCmec IV (68,2%) o mais frequente, além de elevada presença da leucocidina de Panton-Valentine (53,8%). Este estudo pode evidenciar a presença de onze sequencias tipo (ST) relacionadas a cinco complexos clonais (CC) entre os isolados, sendo os principais: CC5, CC30 e CC8. Foi caracterizado o clone mais prevalente entre as infecções comunitárias, o ST30-SCCmecIVc-PVL+ e o CC5 como associados às IRAS. Foram identificados ST não descritas previamente e outras não identificadas em infecções na América Latina, além de identificar a baixa frequência do Brazilian endemic clone (BEC), uma linhagem antes circulante, evidenciada em somente 3,3% dos isolados.pt_BR
dc.description.abstract-enMethicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is a major human pathogen associated with a variety of clinical syndromes. The occurrence of bacteremia related to these conditions is associated with high morbidity and mortality. Understanding the epidemiology, clinical trends, and outcomes is important for the development of preventive measures and treatment protocols. Thus, the objective of this study is to analyze the epidemiology and characterize the isolates of MRSA bacteremic infections from hospitals in Porto Alegre, Brazil. This is cohort study was performed from 2014 to 2019, with clinical and epidemiological data and with the characterization of MRSA isolates from blood cultures of patients treated in hospitals in Porto Alegre. The susceptibility to antimicrobials was evaluated by the disk diffusion method and by gradient strips. Genotypic characterization with detection of resistance and virulence genes and molecular typing was performed by in silico detection using data obtained by high throughput sequencing, with Illumina technology. A high incidence of S. aureus bacteremia of 68.5 cases per 100,000 patients per year was described and no statistically significant variation was identified during the period. The proportion of MRSA infections was 22% (range: 19 to 27%). Most patients were male (64.3%), the median age was 62 years and interquartile range (IQR) of 51 to 74 years, and presented with multiple comorbidities, the most frequent: hypertension (45.2%), diabetes mellitus (31.6%), and heart disease (21.1%). Tow severity scores were evaluated, the Charlson comorbidity index median was 5 (IQR: 3 - 6) and the Pitt bacteremia score median was 1 (IQR: 1 - 4). Most infections were healthcareassociated, and the most frequent focus was intravascular devices (28.5%). It was identified a 31.2% 30-day mortality, and two independent risk factors for mortality were identified: Charlson comorbidity index aOR 1.222 (1.061-1.409; p=0.006) and Pitt bacteremia score aOR 1.726 (1.410-2.112; p<0.001). This data suggests that patients with more comorbid conditions or more severe presentation tend to present with higher mortality. Empirical therapy with an anti-MRSA agent was a protective factor aOR 0.319 (0.126-0.806; p=0.016). Most MRSA isolates showed a resistance profile to more than one antimicrobial besides beta-lactams, with a total of 35.1% of the isolates considered multidrug resistant. Through the molecular characterization was possible to identify the presence of five different SCCmec types, with SCCmec IV (68.2%) being the most frequent. High prevalence of Panton-Valentine leucocidin (53.8%) wa detected. This study could evidence the presence of eleven sequence types (ST) related to five clonal complexes (CC) among the isolates: CC5, CC30 and CC8. It was characterized the most prevalent clone among community infections, ST30- SCCmecIVc-PVL+, and identified the CC5 as associated with healthcare-associated infections. Two new ST were described, and others ST not previously identified in infections in Latin America. Finally, low frequency of the Brazilian endemic clone (BEC), a previously circulating lineage, was now evidenced in only 3.3% of the isolates.en
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufcspa.edu.br/handle/123456789/3092
dc.language.isopt_BR
dc.relation.requiresTEXTO - Adobe Reader
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/br/
dc.subjectStaphylococcus aureuspt_BR
dc.subjectStaphylococcus aureus Resistente à Meticilina - MRSApt_BR
dc.subjectBacteriemiapt_BR
dc.subjectEpidemiologiapt_BR
dc.subject[en] Staphylococcus aureusen
dc.subject[en] Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus - MRSAen
dc.subject[en] Bacteremiaen
dc.subject[en] Epidemiologyen
dc.titleEpidemiologia de infecções bacterêmicas por Staphylococcus aureus resistentes a meticilina (MRSA) de Porto Alegrept_BR
dc.typeTesept_BR
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