Estudos estruturais do complexo enzimático mTOR (mechanistic target of rapamycin) com abordagem in silico para delineamento de estratégias para desenvolvimento racional de inibidores do complexo enzimático

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dc.contributor.advisorCaceres, Rafael Andrade
dc.contributor.authorKist, Roger
dc.date.accessioned2022-05-16T17:43:51Z
dc.date.accessioned2023-10-09T16:32:45Z
dc.date.available2022-05-16T17:43:51Z
dc.date.available2023-10-09T16:32:45Z
dc.date.date-insert2022-05-16
dc.date.issued2022
dc.descriptionTese (Doutorado)-Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre.pt_BR
dc.description.abstractA via PI3K/Akt/mTOR é uma via de sinalização intracelular importante na regulação do ciclo celular que responde a múltiplas questões nutricionais e ambientais. A desregulação dessa via está envolvida em múltiplas patologias humanas. A mTOR (mechanistic target of rapamycin) constitui a principal enzima que exerce o controle intermediário da via de sinalização e a sua ativação depende principalmente do acoplamento da subunidade mLst8 (mammalian lethal with Sec13 protein 8). Dada a importância da ligação mTOR-mLst8 no mecanismo de ativação da mTOR, à escassez de estudos direcionados a compreender o comportamento da quinase frente a esse acoplamento, a exploração das características da interação proteína proteína na interface mTOR-mLst8 e o intuito de fornecer conhecimento para o desenvolvimento de novad estratégias de controle da via metabólica, neste trabalho empregamos dinâmica molecular com modelos coarse-grained para obter trajetórias do sistema mTOR-mLst8 a fim de avaliar as características da ligação mTOR-mLst8 e o perfil de ligação através de cálculos de energia livre, decomposição energética por resíduo e identificação de ligações de hidrogênio na interface mTOR-mLst8.pt_BR
dc.description.abstract-enThe PI3K/Akt/mTOR pathway is an important intracellular signaling pathway in cell cycle regulation that responds to multiple nutritional and environmental issues. Deregulation of this pathway is involved in multiple human pathologies. mTOR (mechanistic target of rapamycin) is the main enzyme that performs the intermediate control of the signaling pathway and its activation depends mainly on the binding of the mLst8 subunit (mammalian lethal with Sec13 protein 8). Due to the importance of the mTOR-mLst8 binding in the mTOR activation mechanism, the scarcity of studies aimed at understanding the kinase behavior regarding the binding, the exploration of the characteristics of the protein-protein interaction at the mTOR-mLst8 interface and the aim of providing knowledge for the development of new strategies to control the metabolic pathway, in this work we used molecular dynamics with coarse-grained models to obtain trajectories of the mTOR-mLst8 system in order to evaluate the characteristics of the mTOR-mLst8 binding and the binding profile through free energy calculations, energy decomposition per residue and identification of hydrogen bonds at the mTOR-mLst8 interface.pt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufcspa.edu.br/handle/123456789/1861
dc.language.isopt_BRpt_BR
dc.publisherWagner Wessfllpt_BR
dc.relation.requiresTEXTO - Adobe Readerpt_BR
dc.rightsAcesso Aberto Imediatopt_BR
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/*
dc.subjectmTORpt_BR
dc.subjectmLST8pt_BR
dc.subjectModelos Coarse-Grainedpt_BR
dc.subjectDinâmica Molecularpt_BR
dc.subjectInteração Proteína-Proteínapt_BR
dc.subject[en] Molecular Dynamics Simulationen
dc.titleEstudos estruturais do complexo enzimático mTOR (mechanistic target of rapamycin) com abordagem in silico para delineamento de estratégias para desenvolvimento racional de inibidores do complexo enzimáticopt_BR
dc.typeTesept_BR
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