Comparação entre os métodos de antigenemia e de PCR em tempo real para citomegalovírus em transplantados renais

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dc.contributor.advisorPasqualotto, Alessandro Comarú
dc.contributor.advisor-coAllende, Odelta dos Santos
dc.contributor.authorCaurio, Cássia Ferreira Braz
dc.date.accessioned2022-06-08T17:26:16Z
dc.date.accessioned2023-10-09T18:55:17Z
dc.date.available2022-06-08T17:26:16Z
dc.date.available2023-10-09T18:55:17Z
dc.date.date-insert2022-06-08
dc.date.issued2019
dc.descriptionDissertação (Mestrado)-Programa de Pós-Graduação em Patologia, Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre.pt_BR
dc.description.abstractIntrodução: O citomegalovírus (CMV) é considerado o patógeno de maior importância clínica em pacientes transplantados renais. Objetivos: Desenvolver e validar um ensaio in-house de PCR em tempo real (qPCR) para CMV calibrado com o 1º Padrão Internacional da Organização Mundial da Saúde e comparar com o exame de antigenemia em uma coorte de pacientes transplantados renais. Além disso, estabelecer ponto de corte para início da terapia preemptiva. Material e Métodos: Para desenvolvimento e validação do ensaio foram realizados testes de otimização, sensibilidade e especificidade analíticas, precisão e reprodutibilidade interlaboratorial. A comparação entre as metodologias foi feita por análise descritiva, coeficiente de Kappa e correlação de Spearman. Foi realizada uma análise de curva ROC para determinar um ponto de corte para início de tratamento. Resultados: O ensaio desenvolvido se mostrou sensível, específico, preciso e linear. 232 amostras de 30 pacientes foram analisadas para antigenemia e qPCR. Os resultados mostraram que 163 (70,26%) amostras eram concordantes. Dos 69 com resultados discordantes, 54 (78,26%) foram positivos no teste de qPCR dias antes ou depois da antigenemia. O teste qPCR apresentou mediana de 12 dias (0–25) para positivação antes da antigenemia e de 9 dias (0–28) para negativação após a antigenemia. O coeficiente Kappa apresentou concordância justa (0,435; p <0,001), a correlação de Spearman se apresentou moderada (0,663; p <0,001). A análise da curva ROC encontrou um ponto de corte de 3.430 UI/ml (Log 3,53) (p <0,001) com base em 10 células/105 leucócitos na antigenemia e na decisão de tratamento pelo médico. Conclusão: As metodologias apresentaram concordância justa e correlação moderada. O qPCR apresentou-se como um teste sensível, permitindo melhor avaliação da DNAemia nos pacientes, obtendo resultados positivos semanas antes da antigenemia. O ponto de corte estabelecido neste estudo permite a validação do teste para a população de nossa instituição, como sugerem diretrizes internacionais.pt_BR
dc.description.abstract-enIntroduction: Cytomegalovirus (CMV) is considered the most clinically important pathogen in kidney transplant patients. Objectives: To develop and validate a real-time in-house PCR (qPCR) assay for CMV calibrated with the 1st WHO International Standard for Human Cytomegalovirus and compare with the antigenemia test in a cohort of kidney transplant patients. Also, establish a threshold for initiation of preemptive therapy. Material and Methods: For development and validation of the assay the following tests were performed: optimization, analytical sensitivity and specificity, precision and interlaboratory reproducibility. Methodologies were compared by descriptive analysis, Kappa coefficient and Spearman correlation. A ROC curve analysis was performed to determine a threshold for treatment initiation. Results: The in-house assay was sensitive, specific, precise and linear. 232 samples from 30 patients were analyzed for antigenemia and qPCR. Results showed that 163 (70.26%) samples were concordant. Of 69 samples with discordant results, 54 (78.26%) were positive on the qPCR assay days before or after antigenemia. The qPCR test presented a median of 12 days (0–25) for positivity before antigenemia and 9 days (0–28) for negativity after antigenemia. The Kappa coefficient showed fair agreement (0.435; p <0.001), Spearman correlation was moderate (0.663; p <0.001). ROC curve analysis found a threshold of 3,430 IU / ml (Log 3.53) (p <0.001) based on 10 cells/105 leukocytes in antigenemia and the physician's decision to treat. Conclusion: The methodologies showed fair agreement and moderate correlation. The qPCR was presented as a sensitive test, allowing a better evaluation of the DNAemia in the patients, obtaining positive results weeks before the antigenemia. The cutoff point established in this study allows the validation of the test for the population of our institution, as suggested by international guidelines.pt_BR
dc.description.sponsorshipCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)pt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufcspa.edu.br/handle/123456789/1867
dc.language.isopt_BRpt_BR
dc.publisherWagner Wessfllpt_BR
dc.relation.requiresTEXTO - Adobe Readerpt_BR
dc.rightsAcesso Aberto Imediatopt_BR
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/*
dc.subjectCitomegaloviruspt_BR
dc.subjectInfecções por Citomegaloviruspt_BR
dc.subjectPCR em Tempo Realpt_BR
dc.subjectAntigenemiapt_BR
dc.subject[en] Cytomegalovirusen
dc.subject[en] Cytomegalovirus Infectionsen
dc.subject[en] Real-Time Polymerase Chain Reactionen
dc.titleComparação entre os métodos de antigenemia e de PCR em tempo real para citomegalovírus em transplantados renaispt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR
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