Infecção por SARS-COV-2: fatores associados ao diagnóstico, progressão e marcadores genéticos compartilhados entre obesidade e covid-19 severa

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dc.contributor.advisorGenro, Júlia Pasqualinipt_BR
dc.contributor.advisor-coPellanda, Lucia Campospt_BR
dc.contributor.authorCosta, Giulia Souza dapt_BR
dc.date.accessioned2023-02-06T16:32:48Z
dc.date.accessioned2023-10-09T13:21:43Z
dc.date.available2023-02-06T16:32:48Z
dc.date.available2023-10-09T13:21:43Z
dc.date.date-insert2023-02-06
dc.date.issued2022
dc.descriptionDissertação (Mestrado)-Programa de Pós-Graduação em Biociências, Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre.pt_BR
dc.description.abstractIntrodução: Mais de dois anos após o diagnóstico do primeiro caso de covid-19 no mundo, a doença segue desafiando o sistema de saúde global em muitos aspectos. Considerando os grupos com risco aumentado de desenvolver as formas severas da covid-19, aproximadamente 20% da população mundial é suscetível à infecção grave, fator contrabalanceado pelo esforço global para a expansão da cobertura vacinal. Seguem como um desafio, no entanto, as persistentes iniquidades no acesso à saúde entre as diferentes regiões do mundo: em média, menos de 25% das pessoas de nações de baixa renda receberam ao menos uma dose da vacina contra a covid-19. Neste cenário, cresce a importância da investigação sobre fatores associados ao diagnóstico e desfechos da covid-19 na população, visando embasar o melhor manejo dos pacientes sob uma perspectiva de estratificação de risco. Ainda, segue escasso o conhecimento sobre os fatores que influenciam os tão heterogêneos desfechos clínicos da covid-19 entre a população, sendo esta heterogeneidade um traço característico de doenças multifatoriais de herança genética complexa. A obesidade, uma das principais comorbidades associadas ao curso grave da covid-19, tem uma fisiopatologia fortemente influenciada pelo sistema imunológico e inflamatório. O mesmo acontece com a covid-19, cujos pacientes graves manifestam resposta inflamatória intensa. Isto sugere uma possível ligação entre a fisiopatologia destas duas condições. Objetivo: Investigar a associação de fatores clínico-demográficos, sinais vitais e sintomas apresentados na admissão com diagnóstico e diferentes desfechos clínicos da covid-19 em uma amostra de pacientes suspeitos de infecção por SARS-CoV-2 em atendimento no Sistema Público de Saúde (SUS), e investigar se existem mecanismos genéticos comuns entre a obesidade e a gravidade na covid-19 a partir de uma abordagem genômica com estatísticas sumarizadas. Material e métodos: Foram recrutados 673 pacientes com suspeita de infecção por SARS-CoV-2 testados pelo sistema público de saúde entre setembro de 2020 e fevereiro de 2022. Os dados clínico- demográficos e de sintomas foram obtidos a partir de entrevista direta e os dados de sinais vitais foram medidos na admissão. Os resultados dos exames diagnósticos e os sinais de evolução clínica foram obtidos por meio do monitoramento dos prontuários dos pacientes, após aproximadamente dois meses de sua inclusão no estudo. Os pacientes internados foram acompanhados até a alta ou óbito. Os grupos foram comparados por meio dos testes qui-quadrado de Pearson ou exato de Fisher para variáveis categóricas e teste t de Student ou Mann-Whitney para variáveis quantitativas, de acordo com a normalidade ou não das distribuições (teste de Kolmogorov-Smirnov para normalidade). Regressões logísticas (LR) do tipo stepwise backward foram conduzidas. Para o objetivo genético, foram utilizados dados baseados em estatísticas sumarizadas de estudos de associação ampla do genoma e realizada uma metanálise no software MAGMA v.1.10. Resultados e conclusão: Em uma amostra de pacientes com suspeita de covid-19 em atendimento no sistema público de saúde no Brasil, a positividade foi alta, e as principais características associadas à doença foram febre referida, perda de olfato, maior frequência cardíaca, ausência de dor de garganta, ausência de bronquite e ausência de rinite alérgica. Os principais fatores associados a um curso clínico grave da doença foram etnia preta ou parda, maior IMC, presença de doenças autoimunes, dispneia, ausência de congestão nasal e menor oximetria na admissão. Como resultado da metanálise, os loci 3p21.31 e 21q22.1, consistentemente associados com suscetibilidade à covid-19 grave, foram associados com hospitalização por covid-19 e com obesidade, e uma nova associação dos genes PCDH1, LTF, DNAJC27, SS18, e PSMA8 foi encontrada. As características associadas ao diagnóstico e à doença grave podem ajudar os sistemas de saúde a identificar rapidamente e gerenciar com eficiência pacientes com suspeita de covid-19, especialmente aqueles admitidos inicialmente sem a doença grave. A comorbidade entre obesidade e covid-19 grave pode ser mediada por fatores genéticos comuns que desempenham um papel importante nas vias da doença crítica.pt_BR
dc.description.abstract-enIntroduction: More than two years after the first case of Covid-19, the disease remains challenging the global health system in many aspects. Considering groups at increased risk of developing severe Covid-19, approximately 20% of the world's population is susceptible to severe infection, a factor counterbalanced by the global effort to expand vaccination coverage. However, the persistent health inequities between different regions of the world are an obstacle: less than 25% of people from low-income nations have received at least one dose of the Covid-19 vaccine. In this scenario, the research on factors associated with diagnosis and prognosis is even more relevant to support the best management of patients under a risk strategy. Still, the factors influencing the heterogeneous response to SARS-CoV-2 infection are not well understood. But this characteristic suggests that it is a disease of complex genetic inheritance. In the pathophysiology of obesity, one of the main comorbidities associated with the severe course of Covid-19, the immune and inflamed system plays an important role. The same occurs with Covid-19, in which the severe patients manifest intense inflamed response. This suggests a possible link between the pathophysiology of these two conditions. Objective: To investigate if there is an association of clinical-demographic factors, vital signs, and symptoms of patients with suspect SARS-CoV-2 infection presenting the Public Health System with the diagnostic and Covid-19 different outcomes. Also, to investigate the potential common genetic mechanisms between obesity and Covid-19 severity from a genomic approach, with summarized statistics. Material and methods: Patients with suspected SARS-CoV-2 infection tested by the public health system were included between September 2020 and February 2022, in a Covid-19 isolation unit in southern Brazil. Clinical-demographic and symptoms data were obtained from direct interviews and vital signs data were measured at admission. Diagnostic test results and signs of clinical course were obtained by monitoring patients’ medical records through electronic systems of the public health system. Approximately two months after patients’ admission, their clinical data regarding hospitalization, use of oxygen therapy, intubation, CT scan, and level of pulmonary impairment were accessed. The hospitalized patients were follow-up until discharge or death. The groups were compared using Pearson’s chi-square or Fisher’s exact tests for categorical variables, and the Student t-test or Mann–Whitney test for quantitative variables, according to the normality or not of the distributions (Kolmogorov-Smirnov test for normality). Stepwise backward logistic regressions (LR) were conducted. For genetic objectives, we use data based on summary statistics of genome-wide association studies to perform a gene-based cross-trait metanalysis in MAGMA v.1.10 software. Results and conclusions: In a sample of patients with suspected Covid-19 seeking attention in the public health system in Brazil, positivity was high, and the main characteristics associated with the disease were referred fever, loss of smell, higher heart rate, absence of sore throat, absence of bronchitis, and absence of allergic rhinitis. The main factors associated with a severe clinical course of illness were black or brown ethnicity, higher BMI, autoimmune diseases, dyspnea, absence of nasal congestion, and lower oximetry at admission. The loci 3p21.31 and 21q22.1, consistently associated with susceptibility to critical illness in Covid- 19, were confirmed in our study, and a new association of PCDH1, LTF, DNAJC27, SS18, and PSMA8 genes were found. The characteristics associated with diagnosis and the severe illness may help healthcare systems quickly identify and efficiently manage patients with suspected Covid-19, especially those initially admitted with a non-severe disease. Comorbidity between obesity and severe Covid-19 may be mediated by common genetic factors that play an important role in the critical illness pathways.pt_BR
dc.description.sponsorshipPrefeitura Municipal de Capão da Canoa, Rio Grande do Sul (PMCC/RS); Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) – Brasil ; Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)pt_BR
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufcspa.edu.br/handle/123456789/1972
dc.language.isopt_BRpt_BR
dc.relation.requiresTEXTO - Adobe Readerpt_BR
dc.rightsAcesso Aberto Imediatopt_BR
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/br/en
dc.subjectSARS-CoV-2pt_BR
dc.subjectCOVID-19pt_BR
dc.subjectSinais e Sintomaspt_BR
dc.subjectGenômicapt_BR
dc.subjectObesidadept_BR
dc.subject[en] Signs and Symptomsen
dc.subject[en] Genomicsen
dc.subject[en] Obesityen
dc.titleInfecção por SARS-COV-2: fatores associados ao diagnóstico, progressão e marcadores genéticos compartilhados entre obesidade e covid-19 severapt_BR
dc.typeDissertaçãopt_BR
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