Análise funcional e estrutural da proteína Kin3 em Saccharomyces cerevisiae
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Data
2017
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Resumo
A proteína Kin3 é a única representante da família das NIMA-related kinases em Saccharomyces cerevisiae. Tendo em vista a existência de poucos estudos sobre a possível função da proteína Kin3 na resposta a danos no DNA e a inexistência de estudos sobre sua estrutura, o objetivo deste trabalho foi elucidar o envolvimento da proteína Kin3 na reposta a danos no DNA in vitro, considerando interações genéticas e compreendendo aspectos estruturais em modelos in silico. Primeiramente foi avaliado o papel da Kin3 na resposta a metil metano sulfonato (MMS), explorando interações previamente descritas com Mre11 e Srs2. Os resultados mostraram que a estratégia de tratamento de 2 h de exposição seguindo de 1 h de recuperação foi eficiente em induzir quebras no DNA. Adicionalmente, um perfil epistático de Kin3 com Mre11 e Rad52 foi encontrado, sugerindo um possível envolvimento com a via de recombinação homóloga. Esta hipótese foi corroborada com um efeito aditivo na taxa de mutação do duplo mutante kin3∆rad52∆. Posteriormente, foi realizada a modelagem da estrutura da proteína Kin3, com e sem ATP e cofator (Mg+2) e as conformações do loop de ativação após simulação por dinâmica molecular foram exploradas. Os principais achados mostraram a disrrupção de uma pequena estrutura de α-hélice na ausência de ATP, indicando que a ligação com o nucleotídeo é importante para estabilizar esta região. Esta modificação não aproximou os resíduos de serina e treonina localizados no loop de ativação do fosfato γ do ATP, o que permitiria a reação de catálise, não modificou a posição do motivo DFG ou o nucleotídeo para a posição na forma ativa. Assim, neste trabalho foi explorada a função da proteína Kin3 na resposta a DSBs, sugerindo um envolvimento mais significativo com a via da recombinação homóloga. Adicionalmente, foi estabelecida pela primeira vez informações sobre a estrutura da Kin3.
Descrição
Dissertação (Mestrado)-Programa de Pós-Graduação em Biociências, Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre.
Palavras-chave
Kin3, Função, Resposta a Danos, MMS, Estrutura, ATP, [en] Adenosine Triphosphate