Microbioma e diversidade bacteriana do trato respiratório superior em pacientes infectados pelo vírus Influenza A
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Data
2016
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Resumo
Introdução: O vírus influenza A (IAV) é um dos principais agentes etiológicos da síndrome
respiratória aguda grave (SRAG) em humanos, podendo causar pandemias. A
mais recente pandemia por IAV ocorreu em 2009, sendo ocasionada pelo
subtipo H1N1. Frequentemente é reportada uma associação positiva na
interação entre bactérias patogênicas e vírus respiratórios nas infecções do
trato respiratório, o que, por sua vez, tem relação com os sintomas e o
desfecho da SRAG.
Objetivos: Investigar o microbioma bacteriano do trato respiratório superior em pacientes
infectados pela linhagem IAV pandêmica de 2009.
Material e Métodos Um total de 144 amostras de aspirado de nasofaringe coletadas em 2012 e
enviadas para o LACEN-RS para diagnóstico viral foram selecionadas para o
estudo. Todas as amostras foram provenientes de pacientes hospitalizados por
apresentarem SRAG. Realizou-se PCR espécie específico para a identificação
de bactérias patogênicas, método de fingerprinting por PCR para observação
da diversidade bacteriana e, por fim, sequenciamento de alto desempenho para
identificar a composição do microbioma bacteriano.
Resultados A PCR identificou a presença de bactérias patogênicas em mais de dois terços
das amostras testadas. No entanto, a presença bacteriana não esteve
associada à presença de IAV pandêmico. A PCR fingerprinting resultou na
identificação da menor diversidade bacteriana nos pacientes positivos para o
influenza A pandêmico com pneumopatia crônica quando comparados àqueles
sem a mesma. O microbioma bacteriano de pacientes positivos para o IAV
pandêmico apresentou maior frequência de sequências bacterianas do filo
Firmicutes, enquanto que o microbioma de pacientes negativos apresentaram
maior frequência para o filo Proteobacteria.
Conclusões Os pacientes com doença crônica do trato respiratório infectados pelo IAV
estão mais propensos à baixa diversidade bacteriana e, consequentemente, à
dominância de linhagens potencialmente patogênicas. O IAV(H1N1)pdm09 é
um importante modulador da composição do microbioma favorecendo, o
gênero Streptococcus em detrimento aos gêneros pertencentes ao filo
Proteobacteria.
Descrição
Tese (Doutorado)-Programa de Pós-Graduação em Patologia, Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre.
Palavras-chave
Metabarcode, Bacterioma, RISA, Pandemia, IAV(H1N1)pdm09, Vírus da Influenza A Subtipo H1N1, [en] Pandemics, [en] Influenza A Virus, H1N1 Subtype