Informática Biomédica - TCC

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Navegando Informática Biomédica - TCC por Assunto "[en] Genomics"

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    Genômica evolutiva de bactérias do gênero Mycoplasma: análise teórico-computacional e desenvolvimento de pipeline
    (2018) Vedovatto, Meiski Mariá; Thompson, Claudia Elizabeth
    O estudo da genômica utilizando ferramentas de filogenômica tem sido possibilitado devido à disponibilidade de um grande número de sequências depositadas nos bancos de dados, resultantes do desenvolvimento de novas tecnologias de sequenciamento. A importância desse tipo de abordagem reside no fato de permitir uma melhor compreensão dos processos evolutivos que moldam os genomas e do relacionamento evolutivo entre eles. Adicionalmente, os estudos in silico possibilitam a obtenção de respostas para diversas perguntas biológicas referentes à evolução molecular dos genomas e de seus genes e proteínas. Bactérias do gênero Mycoplasma possuem um genoma de tamanho relativamente pequeno e grande dependência dos nutrientes supridos pelo hospedeiro. Exercem os mais diversos estilos de vida, sendo que a maior parte das espécies são parasitas responsáveis por doenças em humanos, outros animais e plantas. Uma importante hipótese evolutiva sobre esse grupo indica que passou por um processo de evolução degenerativa que levou à perda da parede celular. Em 2013, foi realizado um estudo que analisou as relações evolutivas entre 31 espécies do gênero Mycoplasma. Atualmente, mais genomas estão disponíveis nos bancos de dados biológicos públicos e a análise das sequências depositadas pode levar a um melhor entendimento de aspectos evolutivos relacionados a essas bactérias. O principal objetivo deste trabalho foi o desenvolvimento de um pipeline de análise filogenômica focado na análise de genomas bacterianos e a caracterização genômica e evolutiva do gênero Mycoplasma a partir de 83 espécies utilizando ferramentas como Proteinortho, GUIDANCE, Prottest, PhyML and MrBayes. Nosso pipeline representa um importante avanço para a automatização de processos e análises relacionadas à genômica funcional evolutiva de espécies bacterianas.