Genômica evolutiva de bactérias do gênero Mycoplasma: análise teórico-computacional e desenvolvimento de pipeline
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Data
2018
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Resumo
O estudo da genômica utilizando ferramentas de filogenômica tem sido possibilitado devido à
disponibilidade de um grande número de sequências depositadas nos bancos de dados, resultantes
do desenvolvimento de novas tecnologias de sequenciamento. A importância desse tipo de
abordagem reside no fato de permitir uma melhor compreensão dos processos evolutivos que
moldam os genomas e do relacionamento evolutivo entre eles. Adicionalmente, os estudos
in silico possibilitam a obtenção de respostas para diversas perguntas biológicas referentes à
evolução molecular dos genomas e de seus genes e proteínas. Bactérias do gênero Mycoplasma
possuem um genoma de tamanho relativamente pequeno e grande dependência dos nutrientes
supridos pelo hospedeiro. Exercem os mais diversos estilos de vida, sendo que a maior parte das
espécies são parasitas responsáveis por doenças em humanos, outros animais e plantas. Uma
importante hipótese evolutiva sobre esse grupo indica que passou por um processo de evolução
degenerativa que levou à perda da parede celular. Em 2013, foi realizado um estudo que analisou
as relações evolutivas entre 31 espécies do gênero Mycoplasma. Atualmente, mais genomas estão
disponíveis nos bancos de dados biológicos públicos e a análise das sequências depositadas pode
levar a um melhor entendimento de aspectos evolutivos relacionados a essas bactérias. O principal
objetivo deste trabalho foi o desenvolvimento de um pipeline de análise filogenômica focado na
análise de genomas bacterianos e a caracterização genômica e evolutiva do gênero Mycoplasma
a partir de 83 espécies utilizando ferramentas como Proteinortho, GUIDANCE, Prottest, PhyML
and MrBayes. Nosso pipeline representa um importante avanço para a automatização de processos
e análises relacionadas à genômica funcional evolutiva de espécies bacterianas.
Descrição
Trabalho de Conclusão de Curso (Graduação)-Informática Biomédica, Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre.
Palavras-chave
Genômica, Evolução Molecular, Mycoplasma, Biologia Computacional, Pipeline, [en] Genomics, [en] Evolution, Molecular, [en] Computational Biology