Avaliação da aplicação clínica de um analisador automatizado de partículas urinárias por citometria de fluxo na triagem de amostras de urina e como preditor de provável contaminação/colonização do trato urinário

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dc.contributor.advisorRotta, Liane Nanci
dc.contributor.advisor-coPoloni, José Antonio Tesser
dc.contributor.authorWalber, Gabriela Blauth
dc.contributor.departmentPrograma de Pós-Graduação em Ciências da Saúde
dc.date.accessioned2024-08-12T14:41:27Z
dc.date.available2024-08-12T14:41:27Z
dc.date.date-insert2024-08-12
dc.date.issued2024-04-05
dc.descriptionDissertação (Mestrado)-Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, Fundação Universidade Federal de Ciências da Saúde de Porto Alegre
dc.description.abstractIntrodução: Infecções do trato urinário (ITUs) estão entre as infecções mais comuns, afetando aproximadamente 150 milhões de pacientes em todo o mundo a cada ano, sendo as mulheres as mais afetadas. Embora a cultura de urina seja considerada o padrão-ouro para o diagnóstico, tem como aspecto negativo o tempo de pelo menos 24h para a emissão dos resultados. Diante disso, o desenvolvimento de ferramentas mais rápidas e precisas para triagem e diagnóstico de ITUs tornou-se fundamental. O Exame Qualitativo de Urina consiste em uma análise simples, rápida e econômica que, em combinação com analisadores automatizados, pode otimizar a produtividade em laboratórios clínicos, mantendo a qualidade e reduzindo custos e tempo de resposta. Objetivo: Avaliar a aplicação clínica do equipamento Sysmex UF-5000 na detecção de ITUs e como preditor de possível contaminação ou colonização do trato urinário. Métodos: Um estudo transversal, observacional e retrospectivo foi conduzido em janeiro e fevereiro de 2021. As partículas urinárias foram avaliadas usando o equipamento Sysmex UF-5000. A cultura de urina foi realizada em placa de ágar de cultura cromogênica, usando MALDI-TOF para identificar o agente etiológico. Todas as avaliações foram realizadas na mesma amostra de urina, obtida de pacientes na Santa Casa de Porto Alegre. Resultados: O crescimento de microrganismos foi negativo em 1761 (69,7%) amostras e positivo em 766 (30,3%). Dentre as amostras positivas, 488 (19,3%) apresentaram agentes etiológicos bacterianos, 240 (9.5%) foram classificadas como culturas mistas e 38 (1,5%) apresentaram crescimento fúngico. O equipamento Sysmex UF-5000 identificou corretamente 1008 (57,2%) amostras negativas e 270 amostras positivas (65,5%), das quais 193/195 (99,0%) e 77/105 (73,3%) foram classificadas com precisão como Gram-negativas e Grampositivas, respectivamente, com 90% de concordância [coeficiente kappa de Cohen de 0,765 (IC 95% 0,652-0,878)]. Através da análise da curva ROC, uma AUC de 0,851 (IC 95%: 0,831-0,871) foi selecionada, com um ponto de corte de 123,8 bactérias/µL (Sensibilidade: 90,0%; Especificidade: 53,6%; Valor preditivo positivo: 31,7%; Valor preditivo negativo: 95,7%; Acurácia: 60,6%). Contagens de leucócitos >141,45/µL combinadas com contagens de bactérias >123,8/µL indicaram 28,9 vezes mais chances de ITUs ao comparar casos com ambos os marcadores abaixo dos pontos de corte. Amostras de urina com contagens de bactérias e células epiteliais (/µL) superiores a 123,8 e 59,05, respectivamente, tinham 9,29 vezes mais chances de 6 serem classificadas como culturas mistas do que amostras com contagens abaixo desses valores. Células epiteliais foram encontradas com mais frequência em amostras de urina com bactérias Gram-positivas do que Gram-negativas, sugerindo que a presença de bactérias Gram-positivas na urina está mais intimamente associada à contaminação ou colonização. Conclusões: Considerando a baixa taxa de falsos negativos (4,3%) e o valor preditivo negativo relativamente alto (95,7%) no ponto de corte de 123,8 bactérias/µL, concluímos que o analisador pode ser usado como uma ferramenta de triagem rápida e apropriada para amostras negativas de urina em nossa população. Bactérias Gram-positivas estão mais frequentemente associadas à contaminação/colonização do trato urinário. Associando contagens de células epiteliais e bactérias na urina, casos como esses podem ser avaliados com maior precisão e rapidez.
dc.description.abstract-enIntroduction: Urinary tract infections (UTIs) are among the most common infections, affecting approximately 150 million patients worldwide each year, with women being the most affected. Although urine culture is considered the gold standard for diagnosis, it is time-consuming to obtain results, typically taking at least 24 hours. Given this, developing faster and more accurate tools for screening and diagnosing UTIs has become crucial. Urinalysis is a simple, rapid, and cost-effective analysis. When combined with automated analyzers, it can optimize productivity in clinical laboratories while maintaining quality and reducing costs and response time. This study aims to evaluate the clinical application of the Sysmex UF-5000 equipment in detecting UTIs and as a predictor of possible contamination or colonization of the urinary tract. Methods: A cross-sectional, observational, retrospective study was conducted in January and February 2021. The urinary particles were evaluated using the Sysmex UF-5000 equipment. Urine culture was performed in chromogenic culture agar plate, using MALDI-TOF to identify the etiological agent. All evaluations were conducted on the same urine sample, obtained from patients at Santa Casa de Porto Alegre. Results: The growth of microorganisms was negative in 1761 (69.7%) samples and positive in 766 (30.3%). Among the positive samples, 488 showed bacterial growth (19.3%), 240 showed mixed cultures (9.5%), and 38 urine cultures had yeast growth (1.5%). The Sysmex UF-5000 equipment correctly identified 1,008 (57.2%) negative samples and 270 positive samples (65.5%), of which 193/195 (99.0%) and 77/105 (73.3%) were accurately classified as Gram-negative and Gram-positive, respectively, with 90% concordance [Cohen's kappa coefficient of 0.765 (95% CI 0.652-0.878)]. Through ROC curve analysis, an AUC of 0.851 (95% CI: 0.831-0.871) was selected, with a cutoff of 123.8 bacteria/µL (Sensitivity: 90.0%; Specificity: 53.6%; Positive predictive value: 31.7%; Negative predictive value: 95.7%; Accuracy: 60.6%). White blood cell counts (WBC) >141.45/µL combined with bacteria counts >123.8/µL indicated 28.9 times higher odds of UTIs when comparing cases with both markers below the cutoffs. Urine samples with bacteria and epithelial cell counts (/µL) higher than 123.8 and 59.05, respectively, had 9.29 times higher odds of being classified as mixed cultures than samples with values below these thresholds. Epithelial cells were found more frequently in urine samples with Gram-positive bacteria than Gramnegative, suggesting that the presence of Gram-positive bacteria in urine is more 8 closely associated with contamination or colonization. Conclusions: Considering the low false-negative rate (4.3%) and the relatively high negative predictive value (95.7%) at the cutoff of 123.8 bacteria/µL, we conclude that, the analyzer can be used as a rapid and appropriate screening tool for negative urine samples in our population. Gram-positive bacteria are more often associated with urinary tract contamination/colonization. Integrating counts of epithelial cells and bacteria in urine, cases like these can be assessed with greater accuracy and speed.
dc.identifier.urihttps://repositorio.ufcspa.edu.br/handle/123456789/2892
dc.language.isopt_BR
dc.relation.requiresTEXTO - Adobe Reader
dc.rightsAcesso Aberto Imediatopt_BR
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/3.0/br/
dc.subjectBactérias
dc.subjectTrato Urinário
dc.subjectAnalisador automatizado
dc.subject[en] Bacteriaen
dc.subject[en] Tract, Urinaryen
dc.subject[en] Automated analyzeren
dc.titleAvaliação da aplicação clínica de um analisador automatizado de partículas urinárias por citometria de fluxo na triagem de amostras de urina e como preditor de provável contaminação/colonização do trato urinário
dc.typeDissertação
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